Силиконды резеңке полимер молекулалары Si-O (кремний-оттегі) байланыстарынан түзілетін тізбекті{0}}тәрізді құрылымдар және олардың негізгі құрамдас бөлігі жоғары молярлық массалық сызықты полисилоксан болып табылады. Si-O-Si байланысы оның негізгі байланыс түрі болғандықтан, кремний атомдары негізінен метил топтарымен байланысады, ал қанықпаған топтардың өте аз мөлшері бүйірлік тізбектерге енгізіледі.
Молекулааралық күштер аз, ал молекулалар бұрандалы құрылымға ие. Метил топтары сыртқа қарай орналасқан және еркін айнала алады, бұл силиконды резеңке басқа қарапайым каучуктерге қарағанда жақсырақ ыстыққа төзімді, электрлік оқшаулау, химиялық тұрақтылық және т.б.
Әдеттегі силикон резеңке, атап айтқанда, полидиформальдегид силоксан, салыстырмалы түрде шағын молекулааралық күштері бар спираль тәрізді молекулалық конфигурацияға ие, осылайша тамаша серпімділікке ие. Сонымен қатар, спираль сыртына бағытталған формальдегид топтары еркін айнала алады, бұл силикон резеңкеге гидрофобтылық және беттің жабыспайтындығы сияқты бірегей беттік қасиеттерді береді.